Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Hdac9Q99N13 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
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Hdac9Q99N13 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Hdac9Q99N13 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Hdac9Q99N13 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
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