Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atp1b4Q99ME6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atp1b4Q99ME6 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms