Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Usp16Q99LG0 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp16Q99LG0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms