Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms