Protein–RNA interactions for Protein: Q99JI4

Psmd6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd6Q99JI4 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms