Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn16Q925N4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Cldn16Q925N4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Cldn16Q925N4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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