Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms