Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms