Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Spdl1Q923A2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Spdl1Q923A2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Spdl1Q923A2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Spdl1Q923A2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Spdl1Q923A2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Spdl1Q923A2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spdl1Q923A2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spdl1Q923A2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spdl1Q923A2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spdl1Q923A2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spdl1Q923A2 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spdl1Q923A2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spdl1Q923A2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spdl1Q923A2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spdl1Q923A2 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spdl1Q923A2 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spdl1Q923A2 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spdl1Q923A2 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Spdl1Q923A2 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Spdl1Q923A2 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Spdl1Q923A2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spdl1Q923A2 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Spdl1Q923A2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spdl1Q923A2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spdl1Q923A2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spdl1Q923A2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spdl1Q923A2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spdl1Q923A2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spdl1Q923A2 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spdl1Q923A2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms