Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Afg3l1Q920A7 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Afg3l1Q920A7 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Afg3l1Q920A7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Afg3l1Q920A7 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Afg3l1Q920A7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Afg3l1Q920A7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Afg3l1Q920A7 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Afg3l1Q920A7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Afg3l1Q920A7 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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