Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp1bQ91YK2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms