Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Creb3l3Q91XE9 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms