Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms