Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15225-201ENSMUST00000120449 1017 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5149-202ENSMUST00000199980 1250 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45425-201ENSMUST00000211727 618 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms