Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cabp4Q8VHC5 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms