Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Smg8Q8VE18 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Smg8Q8VE18 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Smg8Q8VE18 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Smg8Q8VE18 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Smg8Q8VE18 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Smg8Q8VE18 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Smg8Q8VE18 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Smg8Q8VE18 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Smg8Q8VE18 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Smg8Q8VE18 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smg8Q8VE18 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms