Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDV0

Itgbl1, Integrin beta-like protein 1, mousemouse

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Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgbl1Q8VDV0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Itgbl1Q8VDV0 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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Itgbl1Q8VDV0 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Itgbl1Q8VDV0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Itgbl1Q8VDV0 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Itgbl1Q8VDV0 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Itgbl1Q8VDV0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Itgbl1Q8VDV0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Itgbl1Q8VDV0 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Itgbl1Q8VDV0 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Itgbl1Q8VDV0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgbl1Q8VDV0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms