Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Uhrf1Q8VDF2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms