Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam20bQ8VCS3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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