Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCQ6

Sgms1, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 1, mousemouse

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Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms1Q8VCQ6 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Sgms1Q8VCQ6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Sgms1Q8VCQ6 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Sgms1Q8VCQ6 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Sgms1Q8VCQ6 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sgms1Q8VCQ6 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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