Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubxn4Q8VCH8 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubxn4Q8VCH8 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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