Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup58Q8R332 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms