Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
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Vmn1r200Q8R281 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Vmn1r200Q8R281 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
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Vmn1r200Q8R281 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r200Q8R281 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Vmn1r200Q8R281 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Vmn1r200Q8R281 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Vmn1r200Q8R281 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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