Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZT2

Ccsap, Centriole, cilia and spindle-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsapQ8QZT2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcsapQ8QZT2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms