Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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