Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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