Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms