Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brd3Q8K2F0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms