Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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