Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c1Q8K193 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Cldn34c1Q8K193 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
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