Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms