Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc43a2Q8CGA3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms