Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

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Length 565 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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