Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Ccdc113Q8C5T8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ccdc113Q8C5T8 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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