Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm12696-201ENSMUST00000122361 905 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm14582-201ENSMUST00000141697 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Trim35Q8C006 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 AC160030.1-201ENSMUST00000218916 506 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Lilrb4a-215ENSMUST00000220182 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm44090-201ENSMUST00000204669 1834 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 AC132833.1-202ENSMUST00000228875 1690 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Eif3s6-ps4-201ENSMUST00000202873 1388 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Trim35Q8C006 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm8048-201ENSMUST00000182555 996 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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Trim35Q8C006 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm6680-201ENSMUST00000192789 950 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm37676-201ENSMUST00000195496 507 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm18160-201ENSMUST00000214279 827 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 AV026068-225ENSMUST00000225042 490 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 AC151902.1-201ENSMUST00000227800 375 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Klri1-201ENSMUST00000088046 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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