Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ8

Fam53c, Protein FAM53C, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Fam53cQ8BXQ8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Fam53cQ8BXQ8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Fam53cQ8BXQ8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Fam53cQ8BXQ8 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Fam53cQ8BXQ8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam53cQ8BXQ8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam53cQ8BXQ8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Fam53cQ8BXQ8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Fam53cQ8BXQ8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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