Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP1

Triml1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml1Q8BVP1 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Triml1Q8BVP1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Triml1Q8BVP1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Triml1Q8BVP1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Triml1Q8BVP1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Triml1Q8BVP1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms