Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gtf3c4Q8BMQ2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms