Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms