Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ71

Nup93, Nuclear pore complex protein Nup93, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 819 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup93Q8BJ71 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup93Q8BJ71 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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