Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms