Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms