Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms