Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZI6

Lrsam1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, mousemouse

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Length 727 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrsam1Q80ZI6 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Lrsam1Q80ZI6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Lrsam1Q80ZI6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Lrsam1Q80ZI6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrsam1Q80ZI6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Lrsam1Q80ZI6 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrsam1Q80ZI6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrsam1Q80ZI6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrsam1Q80ZI6 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrsam1Q80ZI6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrsam1Q80ZI6 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrsam1Q80ZI6 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrsam1Q80ZI6 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrsam1Q80ZI6 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrsam1Q80ZI6 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrsam1Q80ZI6 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrsam1Q80ZI6 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrsam1Q80ZI6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrsam1Q80ZI6 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrsam1Q80ZI6 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrsam1Q80ZI6 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrsam1Q80ZI6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrsam1Q80ZI6 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrsam1Q80ZI6 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrsam1Q80ZI6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrsam1Q80ZI6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrsam1Q80ZI6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrsam1Q80ZI6 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrsam1Q80ZI6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrsam1Q80ZI6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrsam1Q80ZI6 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrsam1Q80ZI6 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrsam1Q80ZI6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrsam1Q80ZI6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrsam1Q80ZI6 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrsam1Q80ZI6 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrsam1Q80ZI6 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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