Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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NanogQ80Z64 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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NanogQ80Z64 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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NanogQ80Z64 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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NanogQ80Z64 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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NanogQ80Z64 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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NanogQ80Z64 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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NanogQ80Z64 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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NanogQ80Z64 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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NanogQ80Z64 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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NanogQ80Z64 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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NanogQ80Z64 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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NanogQ80Z64 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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NanogQ80Z64 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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