Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms