Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Pcsk9Q80W65 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Pcsk9Q80W65 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Pcsk9Q80W65 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Pcsk9Q80W65 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Pcsk9Q80W65 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Pcsk9Q80W65 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Pcsk9Q80W65 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Pcsk9Q80W65 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Pcsk9Q80W65 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pcsk9Q80W65 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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