Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube3cQ80U95 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms