Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Avl9Q80U56 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Avl9Q80U56 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Avl9Q80U56 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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