Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms